hub / github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills @main
Chat with this repo
7,780 symbols
28,326 edges
1,170 files
5,876 documented · 76%
What it actually does AI analysis from the code graph — generated when you open this
loading…
README
OpenClaw Medical Skills — 医疗 AI 技能库
最大的开源医疗 AI 技能库，专为 OpenClaw 框架设计。
869 个精选技能 · 临床医学 · 基因组学 · 药物发现 · 生物信息学 · 医疗器械
项目简介
OpenClaw Medical Skills 是一个包含 869 个 AI Agent 技能的精选集合，覆盖生物医学与临床研究的完整领域。这些技能专为 OpenClaw / NanoClaw —— 基于 Claude 的个人 AI 助手框架 —— 设计，能将通用 AI 智能体转变为强大的医学与科研研究伙伴。
每个技能都是一个独立模块（SKILL.md 文件），它：
- 为 Agent 注入专业领域知识与工作流
- 连接真实的数据库、API 和计算工具
- 输出结构化的临床或科研相关结果
为什么需要这个技能库？
| 没有技能 | 配备 OpenClaw Medical Skills 后 |
|---|---|
| 对医学的通用 AI 回答 | 真实查询 PubMed / ClinicalTrials.gov / FDA |
| 无生物信息学能力 | RNA-seq、scRNA-seq、GWAS、变异注释流程 |
| 无药物情报 | ChEMBL、DrugBank、DDI 预测、药物警戒 |
| 无临床文档 | SOAP 记录、出院小结、预先授权决策 |
| 无基因组学支持 | VCF 注释、ACMG 分类、多基因风险评分 |
| 无法规指导 | FDA、CE 认证、IEC 62304、ISO 14971 合规 |
本集合整合了来自 12 个以上开源技能仓库的内容，涵盖学术研究工具、临床工作流、法规框架和前沿 AI 驱动的蛋白质设计——让您的 AI 智能体具备媲美专业研究科学家团队的能力。
安装方法
前置要求
OpenClaw 用户
OpenClaw 从以下两个位置加载技能：
| 优先级 | 路径 | 作用域 |
|---|---|---|
| 高 | <workspace>/skills/ |
每个工作区独立（推荐） |
| 低 | ~/.openclaw/skills/ |
全局，所有 Agent 共享 |
方法一 — 克隆并复制（推荐）
# 克隆本仓库
git clone https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills.git
# 安装到当前工作区的 skills 目录
cp -r OpenClaw-Medical-Skills/skills/* <your-workspace>/skills/
# 或安装到全局（所有 Agent 均可使用）
cp -r OpenClaw-Medical-Skills/skills/* ~/.openclaw/skills/
下次会话时技能自动生效，无需重启。
方法二 — OpenClaw CLI
如果您使用 OpenClaw 插件注册表，您可以搜索并安装单个技能。批量安装整个集合建议使用方法一。
openclaw plugins install <skill-slug> # 安装单个技能
openclaw plugins update # 更新所有已安装技能
方法三 — 配置额外技能目录
将本仓库的克隆路径永久配置到 ~/.openclaw/openclaw.json 中：
{
"plugins": {
"local": ["/path/to/OpenClaw-Medical-Skills"]
}
}
这样无需复制文件，即可挂载整个技能集合。
方法四 — 仅安装所需技能
按需选择与您领域相关的技能：
# 示例：临床 + 药物发现技能组合
SKILLS=(
"clinical-reports"
"tooluniverse-drug-research"
"tooluniverse-pharmacovigilance"
"clinicaltrials-database"
"biomedical-search"
"tooluniverse-drug-drug-interaction"
)
for skill in "${SKILLS[@]}"; do
cp -r OpenClaw-Medical-Skills/skills/$skill ~/.openclaw/skills/
done
NanoClaw 用户
NanoClaw 在容器启动时从 container/skills/ 加载技能。
# 克隆并复制到 NanoClaw 容器技能目录
git clone https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills.git
cp -r OpenClaw-Medical-Skills/skills/* /path/to/nanoclaw/container/skills/
# 重建容器使技能生效
cd /path/to/nanoclaw
./container/build.sh
验证安装
安装完成后，向您的 Agent 提问：
你现在有哪些医疗和临床方面的技能？
Agent 应当列出已安装的技能及其功能说明。
技能总览
| 类别 | 数量 | 代表技能 |
|---|---|---|
| 通用与核心 | 10 | 浏览器/搜索、文档处理与开发工作流工具 |
| 医疗与临床 | 119 | 临床报告、决策支持、肿瘤学、影像与医疗 AI |
| 科学数据库 | 43 | 基因组/蛋白/药物数据库与生物医学检索 |
| 生物信息学 (gptomics bio-* 套件) | 239 | 变异分析、测序质控、差异表达、通路与单细胞分析 |
| 组学与计算生物学 | 59 | 单细胞/空间组学、蛋白质组、化学信息学与蛋白设计 |
| ClawBio 管道 | 21 | 面向 scRNA、GWAS、祖先分析与结构生物学的编排流程 |
| BioOS 扩展套件 | 285 | 覆盖肿瘤、免疫、临床 AI 与研究基础设施的扩展智能体 |
| 数据科学与工具 | 93 | 统计、可视化、自动化、模拟与科研工具链 |
| 总计 | 869 |
目录导航
通用与核心
医疗与临床
科学数据库
生物信息学 (gptomics)
- 生物信息学工具与流程
- 生物信息 — 临床数据库与变异分析
- 生物信息 — 测序与读长质控
- 生物信息 — 差异表达与转录组学
- 生物信息 — 通路与网络分析
- 生物信息 — 单细胞与空间组学
- 生物信息 — 表观基因组学与染色质
- 生物信息 — 宏基因组学与微生物组
- 生物信息 — 免疫信息学与流式细胞术
- 生物信息 — 多组学整合
- 生物信息 — 蛋白质组学与代谢组学
- 生物信息 — 结构生物学与化学信息学
- 生物信息 — 流行病学基因组学与因果基因组学
组学与计算生物学
ClawBio 管道
BioOS 扩展套件
- BioOS 扩展生物信息工具套件
- 肿瘤学与精准医学智能体 (BioOS)
- 血液学与血液病 (BioOS)
- 免疫学与细胞治疗 (BioOS)
- 单细胞与空间组学智能体 (BioOS)
- 药物发现与分子设计 (BioOS)
- 临床AI与医疗 (BioOS)
- 研究基础设施与智能体框架 (BioOS)
数据科学与工具
技能列表
🧰 通用与核心
展开/收起该大类
通用工具
点击展开技能列表
| 技能 | 说明 |
|---|---|
| agent-browser | 浏览器自动化。可用于网页研究、阅读文章、与网页应用交互、填写表单、截图、提取数据、测试网页等。任何需要浏览器的场景均可使用。 |
| find-skills | 帮助用户发现和安装 Agent 技能。当用户询问"如何做 X"、"有没有能做 X 的技能"、"是否有 skill 可以……"或希望扩展 Agent 能力时触发。 |
| multi-search-engine | 多搜索引擎集成，支持 17 个引擎（8 个国内 + 9 个国际）。涵盖百度、Bing、360、搜狗、微信、Google、DuckDuckGo、WolframAlpha 等。支持高级搜索语法、时间过滤、站内搜索，无需 API Key。 |
| wikipedia-search | 通过 MediaWiki API 搜索并获取 Wikipedia 结构化内容，提供可靠的百科全书式信息。支持多语言查询。 |
| deep-research | 自主多步骤深度研究。搜索多个信息来源，阅读全文，综合分析后生成结构化报告。适用于综合调研、文献综述、竞品分析或对某一主题的深度挖掘。 |
| 全功能 PDF 工具包——提取文本和表格、创建新 PDF、合并/拆分文档、填写表单、OCR 扫描件。处理任何 .pdf 文件时使用。 | |
| docx | 创建、编辑和分析 Word 文档（.docx）。支持修订追踪、批注、格式保留和文本提取。起草、审阅或提取 Word 文件内容时使用。 |
| xlsx | 电子表格创建、编辑与分析。支持公式、格式设置、数据分析和可视化。处理任何 .xlsx、.xlsm、.csv 或 .tsv 文件时使用。 |
| pptx | 演示文稿创建、编辑与分析。支持布局、演讲者备注、模板和设计定制。处理任何 .pptx 文件时使用。 |
| doc-coauthoring | 结构化文档协作撰写工作流。撰写文档、提案、技术规格、决策文件或类似结构化内容时使用。 |
🏥 医疗与临床
展开/收起该大类
医疗专用工具
点击展开技能列表
| 技能 | 说明 |
|---|---|
| pubmed-search | 搜索 PubMed 科学文献。当用户要求查找论文、搜索文献、查询研究、查找出版物或询问近期研究时触发。 |
| medical-research-toolkit | 查询 14+ 个生物医学数据库，用于药物再利用、靶点发现、临床试验和文献研究。通过统一 MCP 端点访问 ChEMBL、PubMed、ClinicalTrials.gov、OpenTargets、OpenFDA、OMIM、Reactome、KEGG、UniProt 等数据库。 |
| medical-specialty-briefs | 按医学专科生成每日或按需的医学研究简报。检索顶级期刊（NEJM、Lancet、JAMA、BMJ、Nature Medicine）最新研究，提供一句话要点摘要和直达链接。适用于内分泌、心脏病、肿瘤、神经等专科的医学资讯查询。 |
| usmle | 美国医师执照考试备考助手。提供进度追踪、薄弱点分析、题库管理和住院医匹配规划。涵盖 Step 1/2 CK/Step 3 考试结构、IMG 专项指导、分数预测和身心健康支持。 |
| medical-entity-extractor | 从患者消息中提取医学实体，包括症状、药物、检验值、诊断等。 |
| patiently-ai | 为患者简化医疗文件。将医生信件、检查报告、处方、出院小结和临床记录转化为清晰、个性化的通俗语言。 |
| biomedical-search | 综合生物医学信息搜索，整合 PubMed、预印本、临床试验和 FDA 药物标签。由 Valyu 语义搜索驱动，一站式检索多源生物医学数据。 |
| medical-imaging-review | 撰写医学影像 AI 研究的文献综述。适用于撰写综述论文、系统评价或影像相关主题的文献分析。 |
| fhir-developer-skill | FHIR API 开发指南，用于构建医疗数据端点（Patient、Observation、Encounter、Condition、MedicationRequest）。开发或集成 FHIR REST API 时使用。 |
| clinical-trial-protocol-skill | 为药物或医疗器械生成临床试验方案。适用于设计临床研究、编写 FDA 申报文件或制定试验性产品研究方案。 |
| prior-auth-review-skill | 自动化保险预授权（PA）审核。评估医疗必要性，对照覆盖政策进行验证，并生成预授权决定。 |
| clinical-reports | 撰写全面的临床报告——病例报告（CARE 指南）、诊断报告（放射/病理/检验）、临床试验报告（ICH-E3、CSR）及患者文档（SOAP、H&P、出院小结）。符合 HIPAA/FDA/ICH-GCP 规范。 |
| clinicaltrials-database | 通过 API v2 查询 ClinicalTrials.gov。按疾病、药物、地点、状态或分期检索试验，按 NCT ID 获取详情，导出数据用于临床研究和患者匹配。 |
| clinical-decision-support | 生成临床决策支持（CDS）文档，涵盖患者队列分析、治疗建议报告（含 GRADE 证据分级）、生物标志物整合及统计输出（风险比、生存曲线）。适用于药物研发和临床研究。 |
| tooluniverse-clinical-trial-design | 临床试验设计可行性评估。评估患者人群规模、生物标志物流行率、终点选择、对照组分析、安全监测和监管路径。规划 I/II 期试验或评估试验可行性时使用。 |
| tooluniverse-disease-research | 生成全面的疾病研究报告，覆盖流行病学、发病机制、诊断、治疗和在研临床试验。询问疾病、综合征或需要系统性疾病分析时使用。 |
| tooluniverse-literature-deep-research | 深度生物医学文献研究，含靶点消歧、证据分级和主题结构化提取。解析基因/蛋白 ID 及同义词，合成生物学模型并生成可检验假说。适用于深度文献综述或靶点画像。 |
| tooluniverse-clinical-guidelines | 检索 12+ 权威来源的临床实践指南（NICE、WHO、ADA、AHA/ACC、NCCN、SIGN、CPIC 等）。覆盖心脏病、肿瘤、糖尿病、药物基因组学等领域。询问治疗建议或诊疗标准时使用。 |
| tooluniverse-drug-research | 全面的药物研究报告，涵盖药物身份、药理、靶点、临床试验、安全性、药物基因组学和 ADMET 特性。适用于药物画像、安全性评估或临床研发研究。 |
| tooluniverse-drug-repurposing | 基于靶点、化合物和疾病驱动策略识别药物再利用候选。通过分析靶点、生物活性和安全档案，为已批准药物寻找新适应症。 |
| tooluniverse-drug-drug-interaction | 药物相互作用预测与风险评估。分析 CYP450/转运体机制、严重程度分级，提供管理策略。支持多药联用分析（3种以上）和替代用药推荐。 |
| tooluniverse-rare-disease-diagnosis | 基于表型和遗传数据的罕见病鉴别诊断。将症状映射至 HPO 术语，从 Orphanet/OMIM 识别候选疾病，解读意义不明变异（VUS）。 |
| tooluniverse-pharmacovigilance | 分析来自 FDA 不良事件报告、药品说明书警告和药物基因组数据的药物安全信号。计算 PRR/ROR，识别严重不良事件，评估药物基因组风险。 |
| tooluniverse-clinical-trial-matching | 精准医学和肿瘤学的患者-试验智能匹配。从 ClinicalTrials.gov 按分子入选标准、临床标准、生物标志物对齐和地理可及性对试验排序，输出量化试验匹配评分（0-100）。 |
| literature-review | 跨多数据库（PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar）的系统性文献综述。生成格式规范的报告，支持 APA、Nature、Vancouver 等多种引用格式。 |
| tooluniverse-precision-oncology | 基于肿瘤分子图谱提供可操作的治疗建议。解读肿瘤突变，识别 FDA 批准疗法、相关临床试验和耐药机制。 |
| tooluniverse-cancer-variant-interpretation | 肿瘤体细胞变异临床解读。给定基因+变异（如 EGFR L858R、BRAF V600E），评估致癌性、治疗意义和试验入组资格。 |
| tooluniverse-variant-analysis | VCF 文件处理与变异注释分析。解析 VCF，整合 ClinVar/gnomAD/COSMIC 注释，解读临床意义。 |
| tooluniverse-variant-interpretation | 系统性临床变异解读——从原始变异调用到 ACMG 分级建议，整合 ClinVar、gnomAD 和人群数据库证据。 |
| tooluniverse-structural-variant-analysis | 结构变异（SV/CNV）综合分析。分类 SV 类型，评估致病性，解读拷贝数变异的临床意义。 |
| tooluniverse-polygenic-risk-score | 基于 GWAS 汇总统计数据构建和解读多基因风险评分（PRS），计算遗传风险档案并解读 PRS 百分位数。 |
| tooluniverse-precision-medicine-stratification | 整合基因组、临床和治疗数据进行精准医学患者分层，识别治疗相关亚组和生物标志物驱动的治疗选项。 |
| tooluniverse-gwas-trait-to-gene | 利用 GWAS Catalog（50万+关联）和 Open Targets Genetics 的基因座-基因预测，发现与疾病/性状关联的基因。 |
| tooluniverse-gwas-drug-discovery | 将 GWAS 信号转化为药物靶点和再利用机会。执行基因座-基因映射、靶点成药性评估和已有药物识别。 |
| tooluniverse-gwas-study-explorer | 跨队列比较 GWAS 研究并评估可重复性。整合 NHGRI-EBI GWAS Catalog 和 Open Targets Genetics 进行跨研究荟萃分析。 |
| tooluniverse-gwas-finemapping | 通过统计精细定位鉴定 GWAS 基因座的因果变异，计算后验概率和可信集。 |
| tooluniverse-gwas-snp-interpretation | 整合 GWAS Catalog、Open Targets Genetics 和 ClinVar 解读 SNP 的性状关联和功能注释。 |
| tooluniverse-phylogenetics | 系统发育和序列分析——比对处理、进化树构建和进化度量，适用于病原体或物种进化研究。 |
| tooluniverse-epigenomics | 表观基因组数据处理——甲基化芯片分析（CpG 过滤、差异甲基化）、染色质可及性和组蛋白修饰分析。 |
| tooluniverse-rnaseq-deseq2 | 使用 PyDESeq2 进行 RNA-seq 差异表达分析——标准化、离散度估计、Wald 检验、LFC 收缩和通路富集。 |
| tooluniverse-single-cell | 使用 scanpy 进行单细胞 RNA 测序分析——QC、标准化、PCA、UMAP、Leiden 聚类、轨迹分析和细胞类型注释。 |
| tooluniverse-spatial-transcriptomics | 空间转录组学数据分析——在组织架构中映射基因表达，支持 10x Visium、MERFISH、seqFISH 和 Slide-seq 平台。 |
| tooluniverse-spatial-omics-analysis | 空间多组学数据整合分析框架——空间变异基因、空间域注释和组织分辨率多组学分析。 |
| tooluniverse-proteomics-analysis | 质谱蛋白质组学数据分析——蛋白定量、差异表达、翻译后修饰（PTM）和蛋白互作网络构建。 |
| tooluniverse-metabolomics | 代谢组学研究——代谢物鉴定并检索数据库（HMDB 22万+代谢物、MetaboLights、Metabolomics Workbench）。 |
| [tooluniverse-metabolomics-analysis](skills/tooluni |
Extension points exported contracts — how you extend this code
CrisisSignal (Interface)* Crisis Detection System * * Real-time mental health crisis detection using multiple signals. * * Usage: npx tsx cr
skills/crisis-detection-intervention-ai/scripts/crisis_detector.ts
TestCase (Interface)
(no doc)
skills/crisis-detection-intervention-ai/scripts/model_evaluator.ts
EvaluationResult (Interface)
(no doc)
skills/crisis-detection-intervention-ai/scripts/model_evaluator.ts
Metrics (Interface)
(no doc)
skills/crisis-detection-intervention-ai/scripts/model_evaluator.ts
CrisisDetection (Interface)
(no doc)
skills/crisis-detection-intervention-ai/scripts/crisis_detector.ts
Core symbols most depended-on inside this repo
getcalled by 4280
skills/gwas-lookup/api/base_client.py
get
called by 941
skills/biomcp-server/repo/src/biomcp/utils/request_cache.py
run
called by 244
skills/spatial-transcriptomics-agent/repo/src/tools.py
parse
called by 211
skills/biomcp-server/repo/src/biomcp/query_parser.py
log
called by 86
skills/biomcp-server/repo/src/biomcp/workers/worker_entry_stytch.js
search
called by 81
skills/citation-management/scripts/search_pubmed.py
fit
called by 79
skills/bayesian-optimizer/bayesian_optimization.py
get
called by 68
skills/fda-database/scripts/fda_query.py
Shape
Languages
Python98%
TypeScript2%
Modules by API surface
skills/tooluniverse-phylogenetics/test_phylogenetics.py102 symbols
skills/tooluniverse-network-pharmacology/test_network_pharmacology.py79 symbols
skills/tooluniverse-drug-target-validation/test_skill.py78 symbols
skills/biomni-general-agent/repo/biomni/utils.py72 symbols
skills/tooluniverse-epigenomics/test_skill.py67 symbols
skills/biomni-general-agent/repo/biomni/agent/a1.py62 symbols
skills/tooluniverse-variant-analysis/test_variant_analysis.py60 symbols
skills/tooluniverse-clinical-trial-matching/test_skill.py57 symbols
skills/open-notebook/scripts/test_open_notebook_skill.py57 symbols
skills/biomcp-server/repo/tests/bdd/search_trials/test_search.py56 symbols
skills/biomni-general-agent/repo/biomni/tool/pharmacology.py54 symbols
skills/tooluniverse-gene-enrichment/test_gene_enrichment.py52 symbols
Datastores touched
dbDatabase · 1 repos
(mysql)Database · 1 repos
dbnameDatabase · 1 repos
prod-dbDatabase · 1 repos
user1_dbDatabase · 1 repos
user2_dbDatabase · 1 repos
For agents
$ claude mcp add OpenClaw-Medical-Skills \
-- python -m otcore.mcp_server <graph>