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README

Codex Academic Skills

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这是一份给 OpenAI Codex 用的科研向 skill 索引。

优先放官方 skill、明确写过支持 Codex 的仓库，以及 Codex 基本可以直接读取的开放 Agent Skills。

每个 skill 只列一次，放在它最常用的场景下面。真正安装或长期使用前，还是先看一眼上游的 SKILL.md；这个仓库负责指路，不替代原仓库。

目录

什么是 Codex Skills？

Codex skill 是按文件夹组织的任务说明，用来让 Codex 在某类任务上表现得更稳定。一个典型 skill 包含 SKILL.md，也可以带脚本、模板和参考资料。

Codex 会先看到 skill 的名称、简介和路径；只有当任务匹配时，才会读取完整的 SKILL.md。这能节省上下文，但也意味着 skill 太多时会挤占提示词空间。OpenAI 官方文档说明，初始 skill 列表会有上下文预算限制，skill 很多时描述会被缩短，极大规模时部分 skill 可能不会出现在初始列表里。

收录规则

这份清单只保留满足以下条件之一的 skill：

  • 官方 OpenAI Codex skills
  • 上游仓库明确写明支持 Codex，或明确说明与 Codex 互通
  • 基于开放 Agent Skills 格式，且能被 Codex 直接读取或低成本适配

这份清单会主动排除：

  • 只服务于其他平台的 skills
  • 上游链接失效、目录迁移后找不到明确替代路径的条目
  • 与已有条目高度重复、但对科研工作流没有明显新增价值的条目
  • Codex 兼容性说不清楚的仓库

如何使用这份清单

把这个仓库当成科研工作流索引，而不是统一市场。建议先看下面的 Core Picks，再进入具体分类。

按任务类型粗扫：

  • 研究编排、项目推进和模型选择：第 1 类。
  • 上下文工程、agent 设计和结构化输出：第 2 类。
  • 论文写作、正式学术文档和去 AI 味改写：第 3 类。
  • 文献阅读、转写和证据整理：第 4 类。
  • demo、图表、报告和展示材料：第 5 类。
  • 数据、检索、实验追踪和观测：第 6 类。
  • 微调、评测、推理服务和 kernel 优化：第 7 类。
  • mechanistic interpretability 和模型分析：第 8 类。
  • 研究产物、过程记录和可复现性审查：第 9 类。

Core Picks

如果只想快速装一小组，先看这些。它们覆盖面广、来源清楚，也比较不容易造成 skill 列表膨胀。

Skill 简介 地址
autoresearch 编排文献调研、实验迭代、结果综合和论文写作流程。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
notion-research-documentation 在 Notion 中检索资料、整理证据，并生成带引用的简报和报告。 openai/skills
openai-docs 核对最新 OpenAI 产品和 API 文档，并给出有来源依据的建议。 openai/skills
huggingface-best 基于 Hugging Face 官方 benchmark leaderboard 和元数据筛选、比较候选模型。 huggingface/skills
pdf 读取、生成并检查 PDF，适合关注版式和渲染的文档工作。 openai/skills
huggingface-papers 查询 Hugging Face 论文页和结构化论文元数据。 huggingface/skills
academic-plotting 生成论文级图表、消融图和架构图。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
jupyter-notebook 创建结构清晰、可复现的 Jupyter Notebook。 openai/skills
huggingface-datasets 通过 Dataset Viewer API 浏览元数据、行数据、搜索、过滤、parquet 链接和统计信息。 huggingface/skills
huggingface-local-models 选择 GGUF 模型、量化档位和 llama.cpp 命令，支持本地推理。 huggingface/skills
hf-mem 估算 Hugging Face Hub 上 Safetensors 或 GGUF 模型的推理显存和可选 KV cache 需求。 huggingface/skills
huggingface-llm-trainer 在 Hugging Face Jobs 上用 TRL 训练或微调语言模型，覆盖 SFT、DPO、GRPO 和 reward model。 huggingface/skills
lm-evaluation-harness 运行 MMLU、HumanEval、GSM8K、TruthfulQA 等标准 LLM benchmark。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
vllm 以高吞吐方式部署大模型，并提供 OpenAI 兼容接口。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
transformer-lens 用 HookPoints、activation cache 和 causal tracing 研究 transformer 内部机制。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
remove-ai-flavor 清理中文写作里的模板化 AI 味，同时保留事实、立场和原有语气。 B1lli/remove-ai-flavor-writing-skill
ara-compiler 把论文、代码仓库、实验日志和笔记编译成带 claims、evidence 和 provenance 的 Agent-Native Research Artifact。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

Skills 列表

1. 规划与工作流

Skill 简介 地址
project-development 判断任务是否适合 LLM，并设计研究型 agent 架构。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
notion-research-documentation 在 Notion 中检索资料、整理证据，并生成带引用的简报和报告。 openai/skills
notion-knowledge-capture 把对话、笔记和决策沉淀为结构化 Notion 页面。 openai/skills
notion-meeting-intelligence 结合已有上下文准备会议议程、预读材料和决策文档。 openai/skills
autoresearch 编排文献调研、实验迭代、结果综合和论文写作流程。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
brainstorming-research-ideas 用结构化框架帮助发现高价值研究方向。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
creative-thinking-for-research 使用创造性思维框架生成更有新意的研究想法。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
openai-docs 核对最新 OpenAI 产品和 API 文档，并给出有来源依据的建议。 openai/skills
define-goal 把模糊意图整理成可验证的目标，适合长任务开始前定清边界。 openai/skills
huggingface-best 基于 Hugging Face 官方 benchmark leaderboard 和元数据筛选、比较候选模型。 huggingface/skills

2. 上下文与 Agent 设计

Skill 简介 地址
context-fundamentals 解释 agent 系统里的上下文机制。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
context-degradation 诊断 lost-in-the-middle 等上下文退化问题。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
context-compression 在保留关键状态的前提下压缩长会话。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
context-optimization 通过缓存、masking、compaction 和 partitioning 提升有效上下文容量。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
filesystem-context 把文件系统作为上下文溢出层，用于草稿、共享记忆和按需加载。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
latent-briefing 研究用 KV cache 式 latent handoff 降低 orchestrator-worker 系统的 token 成本。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
evaluation 为 agent 系统构建 rubric、回归检测和质量门禁。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
advanced-evaluation 覆盖 LLM-as-a-judge 与偏差控制评测。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
multi-agent-patterns 设计 supervisor、swarm 和层级式多 agent 系统。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
memory-systems 设计跨会话持久记忆，并评估长期检索质量。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
tool-design 设计更适合 agent 使用的工具和 MCP 接口，减少歧义。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
harness-engineering 设计自主 agent harness，覆盖锁定指标、可编辑区域、持久日志、回滚和人工审批边界。 muratcankoylan/Agent-Skills-for-Context-Engineering
dspy 用声明式提示编程和优化器构建结构化 agent 工作流。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
guidance 用正则和语法约束生成，适合结构化输出和多步提示流程。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
instructor 用 Pydantic 校验结构化输出，适合信息抽取、标注和自动化。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
outlines 用语法和有限状态机约束生成结构化输出。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

3. 写作与科研表达

Skill 简介 地址
pdf 读取、生成并检查 PDF，适合关注版式和渲染的文档工作。 openai/skills
huggingface-paper-publisher 在 Hugging Face Hub 上发布论文，并管理论文元数据。 huggingface/skills
ml-paper-writing 面向发表场景撰写 ML、AI 和系统论文。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
systems-paper-writing 为 OSDI、SOSP、ASPLOS、NSDI、EuroSys 等系统论文提供段落级结构蓝图。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
remove-ai-flavor 清理中文写作里的模板化 AI 味，同时保留事实、立场和原有语气。 B1lli/remove-ai-flavor-writing-skill
unslop 审查并改写 AI 味文本，强调事实保留、语气预设和明确的模式检查。 theclaymethod/unslop
peer-review 生成结构化论文或基金评审，覆盖方法、统计、可复现性和报告规范检查。 K-Dense-AI/scientific-agent-skills

4. 文献阅读与证据综合

Skill 简介 地址
transcribe 转写访谈、会议或录音讲座，并可选做说话人区分。 openai/skills
whisper 用 Whisper 做多语种语音识别与翻译，适合访谈、讲座、播客和音频语料。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
huggingface-papers 查询 Hugging Face 论文页和结构化论文元数据。 huggingface/skills
citation-management 检索、校验、去重并格式化学术引用和 BibTeX 元数据。 K-Dense-AI/scientific-agent-skills
llamaindex 搭建研究语料的文档接入与检索管线。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
faiss 为论文库提供高性能向量检索。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
sentence-transformers 生成用于文献检索、聚类和召回的语义向量。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

5. 科研可视化与展示

Skill 简介 地址
huggingface-gradio 用 Python 构建 Gradio Web UI 和交互式研究 demo。 huggingface/skills
huggingface-spaces 构建、部署并调试 Hugging Face Spaces，覆盖 Gradio、Docker、Static、ZeroGPU 和付费硬件。 huggingface/skills
huggingface-trackio 用 Hugging Face Trackio 跟踪训练指标、告警和可视化面板。 huggingface/skills
academic-plotting 生成论文级图表、消融图和架构图。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
presenting-conference-talks 把论文整理成 Beamer 或 PPTX 报告，并附 speaker notes 和讲稿。 Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs
speech 通过 OpenAI Audio API 生成旁白、无障碍朗读和配音音频。 openai/skills
imagegen 生成或编辑位图视觉素材，适合论文插图、信息图、mockup 和 demo 资产。 openai/skills
transformers-js 在浏览器或 Node.js 中运行 Hugging Face 模型，适合网页 demo 和交互式研究产物。 huggingface/skills
stable-diffusion 为多模态研究生成插图、概念图和展示素材。 [Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs](https://github.com/Orchestra-Research/AI-Research-SKI

Core symbols most depended-on inside this repo

fail
called by 9
scripts/validate_skills.py
parse_repo_from_link
called by 1
scripts/validate_skills.py
main
called by 1
scripts/validate_skills.py

Shape

Function 3

Languages

Python100%

Modules by API surface

scripts/validate_skills.py3 symbols

For agents

$ claude mcp add Codex-Academic-Skills \
  -- python -m otcore.mcp_server <graph>

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